细胞STR分型介绍
细胞STR分型(cell line STR genotyping)也称为短串联重复序列(short tandem repeat,STR)分型、简单重复序列(SSR)分型或微卫星标记(Microsatellite)分型,是检测广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列。一般由2-6bp的核心序列串联重复而成,构成了STR基因座的遗传多态性。对于一个特定的个体,染色体上某个特定位置的重复序列的重复次数是固定的,而对于不同的个体重复次数可能不同,这就构成了人群中STR的多态性。由于人类基因组中这种重复序列非常多,通过对STR多态性的检测,就可以区分个体之间的差异,确定亲缘关系。
STR/SSR具有分布广泛均匀、多态性丰富、遵循孟德尔共显性遗传、信息量大、检测简便等优点,STR/SSR分型高效快捷,结果准确,是非常重要的遗传标记,在遗传制图、连锁性分析、亲子鉴定、疾病基因定位和物种多态性研究等领域有着广泛的应用。
微卫星位点通常通过PCR扩增,扩增产物通过电泳分析检测。ABI3730XL遗传分析仪对荧光标记DNA片段进行检测,加上分子量内标进行DNA片段长度计算,使STR分型变得高效快捷,结果也更加精确可靠,可以实现包括单倍型分析、遗传连锁分析或构建遗传连锁图谱等在内的多种应用。
检测内容
人:包含 ATCC 检测的 8 个 STR 和 1 个性别决定位点 Amelogenin 外,另新增了 11 个高度多态性位点 ,共检测 20 个 STR 位点TH01、AMEL、TPOX、D3S1358、D12S391、D5S818、VWA、D13S317、D7S820、D2S1338、D8S1179、D6S1043、CSF1PO、D21S11、D19S433、D16S539、FGA、D18S51、PENTAD、PENTAE。
小鼠:主要对小鼠基因组中8个高度多态性位点:D1Mit159.1、D2Mit395.1、D4Mit170.1、D7Mit40、D11Mit4、D15Mit16、D17Mit51.1和Jarid1进行分析。
送样须知:
送样要求:
1.基因组DNA: OD 260/280 在1.8~2.0之间, 浓度≥50ng/μl,体积≥20μl。
2.新鲜细胞:
(1)细胞数≥106。
(2)贴壁细胞经胰蛋白酶消化后,离心收集细胞沉淀。
(3)悬浮细胞直接离心收集细胞沉淀。
(4)PBS清洗细胞沉淀,尽可能去除培养基与胰酶。
3.冻存细胞:细胞数≥106,冻存细胞从液氮罐中,37℃水浴复苏,融化后离心收集细胞沉淀,尽可能去除冻存液,否则会影响DNA抽提质量。
4.样本寄送:应在送样包裹中放置足量的冰袋或干冰,以减少在运输过程中因温度变化导致DNA降解的可能;如无法使用冷冻寄送,请将细胞沉淀用真空抽干(无残留任何液体、不可加热)。
5.为了保证DNA抽提质量,确保细胞在消化或冻存前,细胞状态良好,处于生长对数期;
不建议以细胞悬液或细胞培养瓶形式寄送样本。
检测结果示例

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